Résumé de la thèse
La gestion des ravageurs des cultures a été de tout temps un enjeu d’importance. Dans l’agriculture moderne, cette gestion passe en particulier par l’utilisation d’insecticides de plus en plus respectueux de l’environnement et de la santé. Dans la lutte contre le ravageur du pommier Cydia pomonella, les bioinsecticides à base du baculovirus CpGV sont utilisés en Europe depuis presque 30 ans. Cependant, l’utilisation massive d’un seul génotype viral a conduit à l’apparition, et la dispersion, d’insectes résistants, compromettant les productions fruitières. Il a été montré que la diversité génétique des baculovirus persiste dans les populations d’insectes résistants, même les génotypes contre lesquels des résistances spécifiques ont été développées. L’utilisation de cette diversité en lutte biologique, en particulier l’obtention d’une infection multiple dans chaque insecte, représente une solution pour limiter l’apparition de résistance chez l’insecte.
L’objectif de ces travaux de recherche est de garantir une gestion durable des résistances, en explorant les avantages de la diversité génétique virale et des infections multiples pour une utilisation agronomique. Ce travail comporte deux parties, l’une portant sur le développement et l’autre sur l’utilisation de méthodes d’exploration des infections en conditions de terrain et de laboratoire. Deux outils permettant le suivi des génotypes de CpGV à différentes échelles ont été développés. Le premier outil est l’adaptation de la technologie ANCHOR TM aux baculovirus, en les rendant autofluorescents, cette technique permet de suivre chaque génotype à l’intérieur d’une cellule. Le deuxième outil est l’utilisation des différences de température de fusion de fragments spécifiques de leurs génomes (HRM),
ici le fragment différentiel du gène pe38 a été utilisé. Cet outil permet de quantifier la fréquence des génotypes CpGV-M et CpGV-R5 dans un insecte infecté, et d’analyser un grand nombre d’échantillons, donc d’établir la prévalence de ces génotypes dans une population. Ces outils ont été mis en application sur le terrain et en laboratoire afin d’évaluer la dynamique des infections multiples. L’étude des interactions entre CpGV-M et CpGV-R5 a permis de mettre en évidence la coopération spécifique entre les deux génotypes. Ces travaux ont permis d’apporter quelques pistes d’amélioration pour les produits commerciaux à base de CpGV et leurs modes d’application en particulier de préconiser une augmentation des doses de CpGV pour contrôler les 2 ème et 3 ème générations d’insecte.
Mots clefs : Cydia pomonella, lutte biologique, baculovirus, CpGV, résistance, diversité génétique,infection multiple, identification génotypale, HRM, ANCHOR TM